Accueil / COVID-19 : cribler les tests positifs pour détecter les variants

Publié le 25 février 2021

Afin de répondre aux nouvelles directives sanitaires, les laboratoires TERANA effectuent le criblage systématique de tous les tests PCR positifs. Objectif : identifier les variants et assurer la surveillance de la contamination due à ces nouvelles souches.

« Le criblage de tous les tests positifs est obligatoire depuis le 23 janvier. Au sein de nos laboratoires TERANA, nous avons immédiatement répondu à cette directive nationale et détectons les variants anglais et sud-africain/brésilien. Nous rendons les résultats dans les meilleurs délais et les laboratoires médicaux les enregistrent dans la plateforme Si-Dep qui recense tous les résultats des tests au niveau national. », précise Florence Baurier, directrice TERANA Cher.

Coronavirus : TERANA en première ligne

Depuis mai 2020, TERANA est venu prêter main-forte aux laboratoires de biologie médicale pour renforcer leur capacité analytique. En 2020, les trois sites de Bourges (18), Nevers (58) et Lempdes (63) ont analysé plus de 130 000 échantillons Covid-19.

Pour assurer les opérations de criblage, la technique est la même que pour réaliser l’analyse PCR de première intention, comme l’explique Marianne Stopyra, technicienne en biologie moléculaire à TERANA Puy-de-Dôme : « À partir du prélèvement nasopharyngé, nous recherchons le matériel génétique du Covid. Nous assurons alors l’extraction du virus avant de l’amplifier pour détecter sa présence. Pour la phase de criblage, nous réalisons une nouvelle amplification qui nous permettra de déterminer l’existence d’un variant ou non. Semaine 7, nous avons effectué près de 700 criblages sur les 8 000 analyses PCR réalisées au sein de nos laboratoires. »

Après le criblage, le séquençage

Spécialisé en biologie et génétique moléculaires, TERANA Nièvre a proposé aux ARS de mettre à disposition son expertise ainsi que ses équipements de pointe pour réaliser le séquençage du génome du Covid-19.

« Seuls trois ou quatre laboratoires départementaux sont équipés d’un séquenceur NGS (new generation sequencing). Cette technique de biologie moléculaire permet de décrypter la séquence du virus, et d’en pister les différents variants. », conclut Chantal Audeval, responsable technique en santé animale à TERANA Nièvre.

LE SAVIEZ-VOUS ?

TERANA assure également la surveillance du Covid dans les eaux usées issues de stations d’épuration.

En savoir plus

Publié le 09/09/2020

Les dépistages Covid-19 étant de plus en plus nombreux, les laboratoires vétérinaires départementaux viennent renforcer les moyens des laboratoires de biologie médicale. Habilité à réaliser des analyses en santé animale, hydrologie et hygiène alimentaire, TERANA est plus que jamais mobilisé.

Implanté à Bourges, TERANA CHER est en ordre de marche depuis le 13 mai 2020. Objectif : renforcer la capacité analytique d’un laboratoire de biologie médicale berruyer. Le site comptabilise plus de 5 000 analyses virologiques (dites PCR) de dépistage de la Covid-19.

« La population se fait de plus en plus tester c’est pourquoi nous avons dû tripler le nombre d’analyses depuis début septembre. Nous avons ainsi franchi les 270 analyses par jour. », explique Florence Baurier, directrice TERANA CHER.

Le 1er septembre 2020, les équipes de TERANA PUY-DE-DÔME commencent elles aussi les premiers tests virologiques Covid-19 pour soutenir deux laboratoires de biologie médicale dans la Loire. Près de 400 écouvillons sont analysés chaque jour sur le site de Lempdes. « À ce jour, plus de 2 000 échantillons ont déjà été analysés par nos techniciens. », précise David Stopyra, directeur adjoint TERANA PUY-DE-DOME.

« Nos équipes sont habituées à manier des agents très pathogènes dont certains transmissibles à l’Homme comme le prion, l’agent responsable de la vache folle (ESB) ou encore les salmonelles et la Fièvre Q. Nous sommes équipés pour réaliser des analyses en grande quantité car nous travaillons habituellement pour prévenir des épidémies animales dans les cheptels. », précise Hélène Roques, responsable du service santé animale de TERANA Puy-de-Dôme. Et de poursuivre : « Les tests PCR (Polymerase Chain Reaction) nous permettent de rechercher le matériel génétique du virus pour détecter sa présence chez un individu suspecté d’être infecté. Ces analyses virologiques, réalisées à partir d’écouvillons nasaux principalement, sont effectuées sur nos sites du Cher et du Puy-de-Dôme. »

 

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